Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
D13Ertd608eQ3UPR8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms