Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrc1Q3UPH1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrc1Q3UPH1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms