Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nlrc4Q3UP24 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nlrc4Q3UP24 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms