Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cobll1Q3UMF0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms