Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc177Q3UHB8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc177Q3UHB8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms