Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFQ8

Carmil3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil3Q3UFQ8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Carmil3Q3UFQ8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Carmil3Q3UFQ8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms