Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem35bQ3U0Y2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem35bQ3U0Y2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem35bQ3U0Y2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem35bQ3U0Y2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem35bQ3U0Y2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem35bQ3U0Y2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem35bQ3U0Y2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem35bQ3U0Y2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem35bQ3U0Y2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem35bQ3U0Y2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem35bQ3U0Y2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem35bQ3U0Y2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms