Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccndbp1Q3TVC7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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