Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ccdc136Q3TVA9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Ccdc136Q3TVA9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms