Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cwc27Q3TKY6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cwc27Q3TKY6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms