Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2f1Q3THK3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gtf2f1Q3THK3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms