Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc69Q3TCJ8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc69Q3TCJ8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc69Q3TCJ8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc69Q3TCJ8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc69Q3TCJ8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc69Q3TCJ8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc69Q3TCJ8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc69Q3TCJ8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc69Q3TCJ8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc69Q3TCJ8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc69Q3TCJ8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc69Q3TCJ8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc69Q3TCJ8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc69Q3TCJ8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc69Q3TCJ8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc69Q3TCJ8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc69Q3TCJ8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc69Q3TCJ8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc69Q3TCJ8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc69Q3TCJ8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc69Q3TCJ8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc69Q3TCJ8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc69Q3TCJ8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc69Q3TCJ8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc69Q3TCJ8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc69Q3TCJ8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc69Q3TCJ8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc69Q3TCJ8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc69Q3TCJ8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc69Q3TCJ8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc69Q3TCJ8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc69Q3TCJ8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms