Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Riiad1Q3KNY5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Riiad1Q3KNY5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Riiad1Q3KNY5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Riiad1Q3KNY5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Riiad1Q3KNY5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Riiad1Q3KNY5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Riiad1Q3KNY5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Riiad1Q3KNY5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Riiad1Q3KNY5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Riiad1Q3KNY5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Riiad1Q3KNY5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Riiad1Q3KNY5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Riiad1Q3KNY5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Riiad1Q3KNY5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Riiad1Q3KNY5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Riiad1Q3KNY5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Riiad1Q3KNY5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Riiad1Q3KNY5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Riiad1Q3KNY5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Riiad1Q3KNY5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Riiad1Q3KNY5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Riiad1Q3KNY5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Riiad1Q3KNY5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Riiad1Q3KNY5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Riiad1Q3KNY5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Riiad1Q3KNY5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Riiad1Q3KNY5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Riiad1Q3KNY5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Riiad1Q3KNY5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Riiad1Q3KNY5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Riiad1Q3KNY5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Riiad1Q3KNY5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Riiad1Q3KNY5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Riiad1Q3KNY5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Riiad1Q3KNY5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Riiad1Q3KNY5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Riiad1Q3KNY5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Riiad1Q3KNY5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms