Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vax1Q2NKI2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vax1Q2NKI2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms