Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cpne9Q1RLL3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cpne9Q1RLL3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms