Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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ptchd1Q14B62 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
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ptchd1Q14B62 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ptchd1Q14B62 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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ptchd1Q14B62 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ptchd1Q14B62 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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ptchd1Q14B62 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ptchd1Q14B62 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ptchd1Q14B62 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ptchd1Q14B62 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ptchd1Q14B62 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ptchd1Q14B62 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ptchd1Q14B62 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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ptchd1Q14B62 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ptchd1Q14B62 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ptchd1Q14B62 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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ptchd1Q14B62 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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ptchd1Q14B62 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ptchd1Q14B62 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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ptchd1Q14B62 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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ptchd1Q14B62 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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ptchd1Q14B62 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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ptchd1Q14B62 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ptchd1Q14B62 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ptchd1Q14B62 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ptchd1Q14B62 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ptchd1Q14B62 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ptchd1Q14B62 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ptchd1Q14B62 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ptchd1Q14B62 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ptchd1Q14B62 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ptchd1Q14B62 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ptchd1Q14B62 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ptchd1Q14B62 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ptchd1Q14B62 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ptchd1Q14B62 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ptchd1Q14B62 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ptchd1Q14B62 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ptchd1Q14B62 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms