Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Rpusd3Q14AI6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Rpusd3Q14AI6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Rpusd3Q14AI6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Rpusd3Q14AI6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rpusd3Q14AI6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rpusd3Q14AI6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rpusd3Q14AI6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rpusd3Q14AI6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpusd3Q14AI6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rpusd3Q14AI6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rpusd3Q14AI6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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