Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V9

Slc45a4, Solute carrier family 45 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a4Q0P5V9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc45a4Q0P5V9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc45a4Q0P5V9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc45a4Q0P5V9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc45a4Q0P5V9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc45a4Q0P5V9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc45a4Q0P5V9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc45a4Q0P5V9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc45a4Q0P5V9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc45a4Q0P5V9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc45a4Q0P5V9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc45a4Q0P5V9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc45a4Q0P5V9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc45a4Q0P5V9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc45a4Q0P5V9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc45a4Q0P5V9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc45a4Q0P5V9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc45a4Q0P5V9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc45a4Q0P5V9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc45a4Q0P5V9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc45a4Q0P5V9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc45a4Q0P5V9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc45a4Q0P5V9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc45a4Q0P5V9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc45a4Q0P5V9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc45a4Q0P5V9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc45a4Q0P5V9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc45a4Q0P5V9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc45a4Q0P5V9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms