Protein–RNA interactions for Protein: Q08297

Rad51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51Q08297 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rad51Q08297 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad51Q08297 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad51Q08297 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad51Q08297 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad51Q08297 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad51Q08297 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad51Q08297 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad51Q08297 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad51Q08297 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad51Q08297 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad51Q08297 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad51Q08297 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad51Q08297 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rad51Q08297 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms