Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13bQ07968 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13bQ07968 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13bQ07968 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
F13bQ07968 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F13bQ07968 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F13bQ07968 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F13bQ07968 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13bQ07968 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13bQ07968 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms