Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Dnal1Q05A62 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dnal1Q05A62 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms