Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdk18Q04899 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdk18Q04899 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms