Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl7Q03366 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl7Q03366 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl7Q03366 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl7Q03366 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl7Q03366 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccl7Q03366 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccl7Q03366 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms