Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gjb4Q02738 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gjb4Q02738 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb4Q02738 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms