Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hoxd1Q01822 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd1Q01822 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms