Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SeleQ00690 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SeleQ00690 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SeleQ00690 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SeleQ00690 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SeleQ00690 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SeleQ00690 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SeleQ00690 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SeleQ00690 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SeleQ00690 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SeleQ00690 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SeleQ00690 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SeleQ00690 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SeleQ00690 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SeleQ00690 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SeleQ00690 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SeleQ00690 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SeleQ00690 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SeleQ00690 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SeleQ00690 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SeleQ00690 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SeleQ00690 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SeleQ00690 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SeleQ00690 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SeleQ00690 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SeleQ00690 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SeleQ00690 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SeleQ00690 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SeleQ00690 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SeleQ00690 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SeleQ00690 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SeleQ00690 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SeleQ00690 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SeleQ00690 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SeleQ00690 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SeleQ00690 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SeleQ00690 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SeleQ00690 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SeleQ00690 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SeleQ00690 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SeleQ00690 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SeleQ00690 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SeleQ00690 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SeleQ00690 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SeleQ00690 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SeleQ00690 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SeleQ00690 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SeleQ00690 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SeleQ00690 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SeleQ00690 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SeleQ00690 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SeleQ00690 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SeleQ00690 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SeleQ00690 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SeleQ00690 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SeleQ00690 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SeleQ00690 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SeleQ00690 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SeleQ00690 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SeleQ00690 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SeleQ00690 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SeleQ00690 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SeleQ00690 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SeleQ00690 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SeleQ00690 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
SeleQ00690 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SeleQ00690 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SeleQ00690 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SeleQ00690 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SeleQ00690 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SeleQ00690 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SeleQ00690 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SeleQ00690 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SeleQ00690 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SeleQ00690 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SeleQ00690 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SeleQ00690 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SeleQ00690 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SeleQ00690 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SeleQ00690 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SeleQ00690 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SeleQ00690 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SeleQ00690 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SeleQ00690 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SeleQ00690 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SeleQ00690 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SeleQ00690 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SeleQ00690 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SeleQ00690 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SeleQ00690 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SeleQ00690 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SeleQ00690 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SeleQ00690 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SeleQ00690 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SeleQ00690 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SeleQ00690 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SeleQ00690 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SeleQ00690 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SeleQ00690 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SeleQ00690 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms