Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
F8a1Q00558 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
F8a1Q00558 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
F8a1Q00558 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
F8a1Q00558 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
F8a1Q00558 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
F8a1Q00558 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
F8a1Q00558 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
F8a1Q00558 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
F8a1Q00558 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
F8a1Q00558 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
F8a1Q00558 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
F8a1Q00558 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
F8a1Q00558 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
F8a1Q00558 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
F8a1Q00558 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
F8a1Q00558 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
F8a1Q00558 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
F8a1Q00558 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
F8a1Q00558 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
F8a1Q00558 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
F8a1Q00558 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
F8a1Q00558 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
F8a1Q00558 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms