Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HmmrQ00547 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HmmrQ00547 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms