Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Stx2Q00262 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Stx2Q00262 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Stx2Q00262 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms