Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smarcc1P97496 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smarcc1P97496 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms