Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vgll3P85442 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vgll3P85442 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vgll3P85442 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vgll3P85442 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vgll3P85442 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vgll3P85442 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vgll3P85442 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vgll3P85442 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vgll3P85442 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vgll3P85442 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vgll3P85442 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vgll3P85442 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Vgll3P85442 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vgll3P85442 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vgll3P85442 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Vgll3P85442 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vgll3P85442 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vgll3P85442 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vgll3P85442 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vgll3P85442 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vgll3P85442 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vgll3P85442 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vgll3P85442 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vgll3P85442 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vgll3P85442 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Vgll3P85442 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vgll3P85442 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vgll3P85442 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vgll3P85442 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vgll3P85442 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vgll3P85442 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vgll3P85442 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms