Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx1P81068 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx1P81068 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx1P81068 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx1P81068 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx1P81068 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Irx1P81068 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx1P81068 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx1P81068 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx1P81068 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Irx1P81068 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms