Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tp53bp1P70399 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tp53bp1P70399 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tp53bp1P70399 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tp53bp1P70399 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tp53bp1P70399 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tp53bp1P70399 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tp53bp1P70399 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tp53bp1P70399 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tp53bp1P70399 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tp53bp1P70399 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tp53bp1P70399 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tp53bp1P70399 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tp53bp1P70399 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tp53bp1P70399 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tp53bp1P70399 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tp53bp1P70399 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tp53bp1P70399 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tp53bp1P70399 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tp53bp1P70399 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tp53bp1P70399 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tp53bp1P70399 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tp53bp1P70399 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tp53bp1P70399 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tp53bp1P70399 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tp53bp1P70399 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tp53bp1P70399 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tp53bp1P70399 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tp53bp1P70399 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tp53bp1P70399 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tp53bp1P70399 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tp53bp1P70399 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tp53bp1P70399 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Tp53bp1P70399 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tp53bp1P70399 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tp53bp1P70399 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tp53bp1P70399 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tp53bp1P70399 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tp53bp1P70399 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tp53bp1P70399 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms