Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp9xP70398 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp9xP70398 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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