Protein–RNA interactions for Protein: P62984

Uba52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba52P62984 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba52P62984 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba52P62984 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uba52P62984 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uba52P62984 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uba52P62984 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Uba52P62984 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Uba52P62984 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uba52P62984 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Uba52P62984 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uba52P62984 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uba52P62984 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uba52P62984 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uba52P62984 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms