Protein–RNA interactions for Protein: P62900

Rpl31, 60S ribosomal protein L31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl31P62900 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl31P62900 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl31P62900 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms