Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm3P62311 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm3P62311 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm3P62311 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm3P62311 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm3P62311 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm3P62311 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm3P62311 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm3P62311 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm3P62311 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lsm3P62311 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lsm3P62311 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lsm3P62311 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lsm3P62311 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lsm3P62311 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lsm3P62311 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lsm3P62311 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lsm3P62311 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lsm3P62311 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lsm3P62311 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lsm3P62311 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lsm3P62311 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms