Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ufm1P61961 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ufm1P61961 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms