Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga11P61622 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga11P61622 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga11P61622 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga11P61622 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga11P61622 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga11P61622 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga11P61622 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga11P61622 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Itga11P61622 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga11P61622 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga11P61622 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga11P61622 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Itga11P61622 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms