Protein–RNA interactions for Protein: P61021

Rab5b, Ras-related protein Rab-5B, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5bP61021 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rab5bP61021 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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