Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nphp4P59240 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nphp4P59240 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Nphp4P59240 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms