Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Csrnp3P59055 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Csrnp3P59055 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms