Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gsc2P56916 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms