Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pdcd5P56812 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pdcd5P56812 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdcd5P56812 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms