Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lim2P56563 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lim2P56563 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lim2P56563 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lim2P56563 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lim2P56563 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lim2P56563 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lim2P56563 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lim2P56563 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lim2P56563 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lim2P56563 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms