Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Faf1P54731 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Faf1P54731 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Faf1P54731 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Faf1P54731 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Faf1P54731 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Faf1P54731 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Faf1P54731 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Faf1P54731 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Faf1P54731 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Faf1P54731 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms