Protein–RNA interactions for Protein: P53994

Rab2a, Ras-related protein Rab-2A, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2aP53994 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rab2aP53994 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab2aP53994 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms