Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cux1P53564 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cux1P53564 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cux1P53564 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Cux1P53564 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cux1P53564 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cux1P53564 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cux1P53564 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Cux1P53564 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cux1P53564 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cux1P53564 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cux1P53564 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cux1P53564 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cux1P53564 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cux1P53564 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cux1P53564 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Cux1P53564 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cux1P53564 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cux1P53564 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cux1P53564 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cux1P53564 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Cux1P53564 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cux1P53564 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Cux1P53564 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cux1P53564 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cux1P53564 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cux1P53564 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Cux1P53564 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cux1P53564 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cux1P53564 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cux1P53564 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cux1P53564 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Cux1P53564 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cux1P53564 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Cux1P53564 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cux1P53564 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cux1P53564 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cux1P53564 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cux1P53564 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cux1P53564 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cux1P53564 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cux1P53564 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cux1P53564 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cux1P53564 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cux1P53564 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cux1P53564 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cux1P53564 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms