Protein–RNA interactions for Protein: P53395

Dbt, Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbtP53395 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DbtP53395 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DbtP53395 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DbtP53395 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DbtP53395 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DbtP53395 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DbtP53395 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DbtP53395 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DbtP53395 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DbtP53395 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DbtP53395 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DbtP53395 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DbtP53395 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DbtP53395 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
DbtP53395 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DbtP53395 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DbtP53395 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DbtP53395 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DbtP53395 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DbtP53395 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DbtP53395 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DbtP53395 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DbtP53395 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DbtP53395 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DbtP53395 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DbtP53395 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DbtP53395 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DbtP53395 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DbtP53395 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DbtP53395 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DbtP53395 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DbtP53395 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DbtP53395 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DbtP53395 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DbtP53395 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DbtP53395 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DbtP53395 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DbtP53395 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DbtP53395 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DbtP53395 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DbtP53395 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DbtP53395 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DbtP53395 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DbtP53395 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DbtP53395 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DbtP53395 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DbtP53395 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DbtP53395 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DbtP53395 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DbtP53395 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DbtP53395 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DbtP53395 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DbtP53395 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DbtP53395 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DbtP53395 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DbtP53395 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DbtP53395 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DbtP53395 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DbtP53395 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DbtP53395 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DbtP53395 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DbtP53395 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DbtP53395 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DbtP53395 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DbtP53395 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DbtP53395 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DbtP53395 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DbtP53395 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DbtP53395 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DbtP53395 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DbtP53395 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DbtP53395 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DbtP53395 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DbtP53395 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DbtP53395 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DbtP53395 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DbtP53395 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DbtP53395 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DbtP53395 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DbtP53395 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DbtP53395 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DbtP53395 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DbtP53395 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DbtP53395 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DbtP53395 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DbtP53395 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DbtP53395 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DbtP53395 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DbtP53395 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DbtP53395 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DbtP53395 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DbtP53395 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DbtP53395 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DbtP53395 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DbtP53395 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DbtP53395 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DbtP53395 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DbtP53395 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DbtP53395 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DbtP53395 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms