Protein–RNA interactions for Protein: P50592

Tnfsf10, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 10, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf10P50592 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tnfsf10P50592 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf10P50592 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf10P50592 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf10P50592 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf10P50592 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf10P50592 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf10P50592 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf10P50592 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf10P50592 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf10P50592 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf10P50592 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf10P50592 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf10P50592 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf10P50592 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf10P50592 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf10P50592 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf10P50592 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf10P50592 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf10P50592 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms